Das Mr Beam Air Filter System enthält drei Filterstufen: Einem Vorfilter für grobe Partikel, einem HEPA Filter und einem Aktivkohlefilter. Die Filter müssen von Zeit zu Zeit ausgetauscht werden, am häufigsten der Vorfilter. Werden z.B. häufig große Holzgravuren gemacht, bei denne viele Partikel freigesetzt werden – sollte der Vorfilter etwa alle 100 Stunden getauscht werden.